На наиболее ценных в природном отношении участках музеев-заповедников созданы ООПТ в виде заказников (ГМЗШ - Вешенский, Еланский) или памятников природы (в АМЗТ - Каменная балка, в РЭМЗ -Пухляковские склоны и Балка Власова, в ГМЗШ - Дуб великан, Урочище Паники, Антипов бор, Урочище Чернь). Их задачами являются сохранение и восстановление биоразнообразия.
Мы не рассматриваем здесь другие музеи-заповедники (Старочеркасский, Новочеркасский, Усадьба атамана Платова и др.), ряд иных объектов исторического и культурного наследия федерального значения (Указ Президента РФ № 176 от 20.02.1995 г.), а также сотни памятников археологии, имеющихся если ни во всех, то в большинстве районов и городов Дона. Территории этих музеев-заповедников и памятников нами не учтены при расчетах площадей ООПТ области.